MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanomassiliicoccus sp. Mx1-Issoire

Total Repeats: 34353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021353	CGGG	2	8	282971	282978	0 %	0 %	75 %	25 %	511059138
5002	NC_021353	GA	3	6	283024	283029	50 %	0 %	50 %	0 %	511059138
5003	NC_021353	GAA	2	6	283095	283100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059138
5004	NC_021353	TGA	2	6	283114	283119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059138
5005	NC_021353	C	6	6	283136	283141	0 %	0 %	0 %	100 %	511059138
5006	NC_021353	CAGAT	2	10	283192	283201	40 %	20 %	20 %	20 %	511059138
5007	NC_021353	AAAAC	2	10	283236	283245	80 %	0 %	0 %	20 %	511059138
5008	NC_021353	TTC	2	6	283328	283333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059138
5009	NC_021353	TGT	2	6	283340	283345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059138
5010	NC_021353	AGT	2	6	283373	283378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059138
5011	NC_021353	TCT	2	6	283458	283463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059138
5012	NC_021353	TTA	2	6	283504	283509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511059138
5013	NC_021353	AAT	2	6	283512	283517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511059138
5014	NC_021353	TGACGG	2	12	283538	283549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	511059138
5015	NC_021353	TCA	2	6	283585	283590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059138
5016	NC_021353	CTTGG	2	10	283621	283630	0 %	40 %	40 %	20 %	511059138
5017	NC_021353	GAT	2	6	283674	283679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059138
5018	NC_021353	AAG	2	6	283737	283742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059138
5019	NC_021353	GGA	2	6	283758	283763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511059138
5020	NC_021353	TA	3	6	283779	283784	50 %	50 %	0 %	0 %	511059138
5021	NC_021353	TC	4	8	283832	283839	0 %	50 %	0 %	50 %	511059138
5022	NC_021353	GAAA	2	8	283851	283858	75 %	0 %	25 %	0 %	511059138
5023	NC_021353	TTC	2	6	283907	283912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059138
5024	NC_021353	CAG	2	6	283946	283951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059138
5025	NC_021353	GAA	2	6	283959	283964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059138
5026	NC_021353	GATGAA	2	12	284091	284102	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	511059138
5027	NC_021353	A	6	6	284115	284120	100 %	0 %	0 %	0 %	511059138
5028	NC_021353	CTT	2	6	284225	284230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059139
5029	NC_021353	GAGC	2	8	284440	284447	25 %	0 %	50 %	25 %	511059139
5030	NC_021353	GAAA	2	8	284482	284489	75 %	0 %	25 %	0 %	511059139
5031	NC_021353	CAT	2	6	284542	284547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059139
5032	NC_021353	TCA	2	6	284564	284569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059139
5033	NC_021353	TGTT	2	8	284658	284665	0 %	75 %	25 %	0 %	511059139
5034	NC_021353	TCA	2	6	284692	284697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059139
5035	NC_021353	GAA	2	6	284756	284761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059139
5036	NC_021353	TGT	2	6	284773	284778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059139
5037	NC_021353	TCTG	2	8	284782	284789	0 %	50 %	25 %	25 %	511059139
5038	NC_021353	TG	3	6	284791	284796	0 %	50 %	50 %	0 %	511059139
5039	NC_021353	TCT	2	6	284821	284826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059139
5040	NC_021353	CTG	2	6	284840	284845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059139
5041	NC_021353	TCA	2	6	284895	284900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059139
5042	NC_021353	TGT	2	6	284908	284913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059139
5043	NC_021353	TGC	2	6	285046	285051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059139
5044	NC_021353	ATA	2	6	285071	285076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511059139
5045	NC_021353	TGGC	2	8	285078	285085	0 %	25 %	50 %	25 %	511059139
5046	NC_021353	AC	3	6	285086	285091	50 %	0 %	0 %	50 %	511059139
5047	NC_021353	TCA	2	6	285097	285102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059139
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5049	NC_021353	TA	3	6	285382	285387	50 %	50 %	0 %	0 %	511059140
5050	NC_021353	ATTTC	2	10	285406	285415	20 %	60 %	0 %	20 %	511059140
5051	NC_021353	GCA	2	6	285575	285580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059140
5052	NC_021353	TGC	2	6	285617	285622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059140
5053	NC_021353	CT	3	6	285660	285665	0 %	50 %	0 %	50 %	511059140
5054	NC_021353	CTG	2	6	285884	285889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059141
5055	NC_021353	CA	4	8	285903	285910	50 %	0 %	0 %	50 %	511059141
5056	NC_021353	TGGTTT	2	12	285911	285922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059141
5057	NC_021353	GCA	2	6	285972	285977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059141
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5059	NC_021353	CAT	2	6	286120	286125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059141
5060	NC_021353	TTCA	2	8	286181	286188	25 %	50 %	0 %	25 %	511059141
5061	NC_021353	CAT	2	6	286192	286197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059141
5062	NC_021353	AAG	2	6	286262	286267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059141
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5065	NC_021353	CTT	2	6	286438	286443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059141
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5069	NC_021353	CTA	2	6	286713	286718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059142
5070	NC_021353	TTC	2	6	286727	286732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059142
5071	NC_021353	TGT	2	6	286746	286751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059142
5072	NC_021353	TGT	2	6	286929	286934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059142
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5081	NC_021353	ATG	2	6	287761	287766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059144
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5087	NC_021353	T	6	6	287940	287945	0 %	100 %	0 %	0 %	511059144
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5103	NC_021353	GAA	2	6	288717	288722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059145
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5106	NC_021353	GA	3	6	289047	289052	50 %	0 %	50 %	0 %	511059146
5107	NC_021353	GAT	2	6	289141	289146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059146
5108	NC_021353	TGG	2	6	289148	289153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511059146
5109	NC_021353	AAGA	2	8	289201	289208	75 %	0 %	25 %	0 %	511059146
5110	NC_021353	CAAA	2	8	289214	289221	75 %	0 %	0 %	25 %	511059146
5111	NC_021353	CAG	2	6	289292	289297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059146
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5113	NC_021353	C	6	6	289368	289373	0 %	0 %	0 %	100 %	511059147
5114	NC_021353	ATG	2	6	289447	289452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059147
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5117	NC_021353	ATC	2	6	289651	289656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059147
5118	NC_021353	GA	3	6	289667	289672	50 %	0 %	50 %	0 %	511059147
5119	NC_021353	ATGC	2	8	289748	289755	25 %	25 %	25 %	25 %	511059147
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5121	NC_021353	GAA	2	6	289872	289877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059147
5122	NC_021353	CTTAT	2	10	289966	289975	20 %	60 %	0 %	20 %	511059147
5123	NC_021353	ATG	2	6	290059	290064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059147
5124	NC_021353	AAATGA	2	12	290065	290076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	511059147
5125	NC_021353	CT	3	6	290079	290084	0 %	50 %	0 %	50 %	511059147
5126	NC_021353	TAC	2	6	290157	290162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059147
5127	NC_021353	GAT	2	6	290189	290194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059147
5128	NC_021353	CTG	2	6	290202	290207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059147
5129	NC_021353	AAG	2	6	290230	290235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059147
5130	NC_021353	TCA	2	6	290322	290327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059147
5131	NC_021353	CAA	2	6	290363	290368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511059147
5132	NC_021353	GAT	2	6	290478	290483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059147
5133	NC_021353	CTG	2	6	290523	290528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059147
5134	NC_021353	CGG	2	6	290588	290593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511059147
5135	NC_021353	TGC	2	6	290606	290611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059147
5136	NC_021353	CAA	2	6	290617	290622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511059147
5137	NC_021353	A	6	6	290682	290687	100 %	0 %	0 %	0 %	511059147
5138	NC_021353	TCA	2	6	290726	290731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059148
5139	NC_021353	ATC	2	6	290813	290818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059148
5140	NC_021353	CTC	2	6	290865	290870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511059148
5141	NC_021353	TCT	2	6	290883	290888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059148
5142	NC_021353	GTTT	2	8	290907	290914	0 %	75 %	25 %	0 %	511059148
5143	NC_021353	CCG	3	9	290924	290932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511059148
5144	NC_021353	GC	3	6	290966	290971	0 %	0 %	50 %	50 %	511059148
5145	NC_021353	TGC	2	6	291045	291050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059148
5146	NC_021353	GCA	2	6	291062	291067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059148
5147	NC_021353	AGC	2	6	291122	291127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059148
5148	NC_021353	TCC	2	6	291286	291291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511059148
5149	NC_021353	GA	3	6	291351	291356	50 %	0 %	50 %	0 %	511059148
5150	NC_021353	AGC	2	6	291418	291423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059148
5151	NC_021353	ACA	2	6	291467	291472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511059148
5152	NC_021353	ACT	2	6	291530	291535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059148
5153	NC_021353	ATG	2	6	291541	291546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059148
5154	NC_021353	TC	3	6	291557	291562	0 %	50 %	0 %	50 %	511059148
5155	NC_021353	TCC	2	6	291571	291576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511059148
5156	NC_021353	CG	3	6	291583	291588	0 %	0 %	50 %	50 %	511059148
5157	NC_021353	CGC	2	6	291642	291647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511059148
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5160	NC_021353	CCA	2	6	291738	291743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	511059149
5161	NC_021353	CTT	2	6	291744	291749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059149
5162	NC_021353	TTC	2	6	291773	291778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059149
5163	NC_021353	ATA	2	6	291790	291795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511059149
5164	NC_021353	T	7	7	291864	291870	0 %	100 %	0 %	0 %	511059149
5165	NC_021353	AT	3	6	294612	294617	50 %	50 %	0 %	0 %	511059150
5166	NC_021353	AT	3	6	294792	294797	50 %	50 %	0 %	0 %	511059150
5167	NC_021353	AGA	2	6	294828	294833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059150
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5171	NC_021353	TAC	2	6	294970	294975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059150
5172	NC_021353	AGC	2	6	295032	295037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059150
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5174	NC_021353	GTA	2	6	295066	295071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059150
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5178	NC_021353	ATC	2	6	295153	295158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059150
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5184	NC_021353	GATG	2	8	295420	295427	25 %	25 %	50 %	0 %	511059150
5185	NC_021353	GAA	2	6	295434	295439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059150
5186	NC_021353	ATT	2	6	295462	295467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511059150
5187	NC_021353	ATGA	2	8	295479	295486	50 %	25 %	25 %	0 %	511059150
5188	NC_021353	CTA	2	6	295502	295507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059151
5189	NC_021353	ATG	2	6	295529	295534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059151
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5192	NC_021353	GGACA	2	10	295918	295927	40 %	0 %	40 %	20 %	511059151
5193	NC_021353	A	6	6	295946	295951	100 %	0 %	0 %	0 %	511059151
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5197	NC_021353	AGAA	2	8	296140	296147	75 %	0 %	25 %	0 %	511059151
5198	NC_021353	TGG	2	6	296157	296162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511059151
5199	NC_021353	CGG	2	6	296205	296210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511059151
5200	NC_021353	AGGA	2	8	296372	296379	50 %	0 %	50 %	0 %	511059151
5201	NC_021353	ACC	2	6	296465	296470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	511059151
5202	NC_021353	ATC	2	6	296484	296489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059151
5203	NC_021353	AT	3	6	296578	296583	50 %	50 %	0 %	0 %	511059151
5204	NC_021353	ACT	2	6	296678	296683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059151
5205	NC_021353	GCT	2	6	296713	296718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059151
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5207	NC_021353	AC	3	6	296777	296782	50 %	0 %	0 %	50 %	511059151
5208	NC_021353	CAA	2	6	296784	296789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511059151
5209	NC_021353	ATC	2	6	296791	296796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059151
5210	NC_021353	CT	3	6	296808	296813	0 %	50 %	0 %	50 %	511059151
5211	NC_021353	TCG	2	6	296834	296839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059151
5212	NC_021353	GTTA	2	8	298180	298187	25 %	50 %	25 %	0 %	511059152
5213	NC_021353	TTGCT	2	10	298259	298268	0 %	60 %	20 %	20 %	511059152
5214	NC_021353	CAG	2	6	298277	298282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059152
5215	NC_021353	ATC	2	6	298330	298335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5216	NC_021353	CAG	2	6	298404	298409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059152
5217	NC_021353	TCA	3	9	298426	298434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5218	NC_021353	AAG	2	6	298503	298508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059152
5219	NC_021353	GCA	2	6	298521	298526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059152
5220	NC_021353	CAT	2	6	298674	298679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5221	NC_021353	TTAG	2	8	298681	298688	25 %	50 %	25 %	0 %	511059152
5222	NC_021353	TTC	2	6	298715	298720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059152
5223	NC_021353	CTGC	2	8	298730	298737	0 %	25 %	25 %	50 %	511059152
5224	NC_021353	AAC	2	6	298746	298751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511059152
5225	NC_021353	TCA	2	6	298804	298809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5226	NC_021353	GA	3	6	298814	298819	50 %	0 %	50 %	0 %	511059152
5227	NC_021353	GCA	2	6	298831	298836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511059152
5228	NC_021353	AGG	2	6	298846	298851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511059152
5229	NC_021353	CAT	2	6	298859	298864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5230	NC_021353	GGT	2	6	298886	298891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511059152
5231	NC_021353	CTT	2	6	298898	298903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059152
5232	NC_021353	TCA	2	6	298909	298914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5233	NC_021353	AG	3	6	298977	298982	50 %	0 %	50 %	0 %	511059152
5234	NC_021353	CCA	2	6	299012	299017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	511059152
5235	NC_021353	TCA	2	6	299026	299031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059152
5236	NC_021353	AAT	2	6	299106	299111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511059152
5237	NC_021353	CTG	2	6	299179	299184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059152
5238	NC_021353	TTC	2	6	299232	299237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059152
5239	NC_021353	TCG	2	6	299265	299270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059152
5240	NC_021353	CTT	2	6	299328	299333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511059152
5241	NC_021353	CTGA	2	8	299388	299395	25 %	25 %	25 %	25 %	511059152
5242	NC_021353	CATGA	2	10	299572	299581	40 %	20 %	20 %	20 %	511059153
5243	NC_021353	GTA	2	6	299594	299599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059153
5244	NC_021353	A	6	6	299625	299630	100 %	0 %	0 %	0 %	511059153
5245	NC_021353	GATT	2	8	299652	299659	25 %	50 %	25 %	0 %	511059153
5246	NC_021353	CAT	2	6	299725	299730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059153
5247	NC_021353	T	6	6	299732	299737	0 %	100 %	0 %	0 %	511059153
5248	NC_021353	ATA	2	6	299786	299791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511059153
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5250	NC_021353	TGG	2	6	299877	299882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511059153
5251	NC_021353	AACT	2	8	299894	299901	50 %	25 %	0 %	25 %	511059153
5252	NC_021353	ATG	2	6	299972	299977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059153
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5257	NC_021353	TCA	2	6	300256	300261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059153
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5264	NC_021353	CTG	2	6	300647	300652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059154
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5266	NC_021353	GTA	2	6	300733	300738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059154
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5282	NC_021353	CAAA	2	8	301475	301482	75 %	0 %	0 %	25 %	511059155
5283	NC_021353	TGA	2	6	301579	301584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059155
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5487	NC_021353	TGG	2	6	312654	312659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511059167
5488	NC_021353	CTG	2	6	312721	312726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511059167
5489	NC_021353	TTG	2	6	312760	312765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511059167
5490	NC_021353	TAC	2	6	312779	312784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511059167
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5492	NC_021353	AGA	2	6	313216	313221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511059168
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5499	NC_021353	TAG	2	6	313414	313419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511059168
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